国务院在东部地区重要中心城市、长三角城市群发展规划中把南京定位为特大城市。结合南京和其它特大城市治理的已有经验可以发现，在建设特大城市过程中，南京将面临一些不容回避的治理风险和挑战，要重点寻求五个层面的有效突破。

　　以革新理念为基点，解决特大城市治理的战略定位问题。特大城市治理是经济结构调整和社会转型的重要组成部分，直接决定着特大城市的经济和社会转型。因此，对特大城市治理的考量要上升到城市整体发展的战略高度，将其同特大城市发展的战略目标联系起来，带动城市精明增长。要看到特大城市治理不仅仅是治理技术的更新换代和优化升级，而且是涉及到对传统城市管理体系及其惯性思维的革新。把特大城市治理同产业布局、城市规划、旧城改造、新城建设、教育资源分布、民生工程建设、公共服务等问题一并统筹考虑，特别是要科学谋划重大工程、重点产业项目与居民工作生活之间的时空距离问题，减少治理成本。要坚持“边建设边治理”的思路，杜绝“先盲目地摊大饼式建设，后不遗余力地善后治理”的落后思维，特别是要建立规划、建设、一体化的行政管理体制，按照“权随事走、人随事调、费随事转”的原则，推进城市治理综合执法，着力解决城市治理“多龙治水”的问题。

　　以化解社会矛盾纠纷为重点，解决特大城市治理的“面子问题”。城市治理不能搞“面子工程”，但同样需要解决面子问题，向人们展示良好的城市形象。这个“面子问题”就是显露在外的各类矛盾和纠纷。特大城市的社会矛盾纠纷具有形态多样、成因复杂、激烈程度高、容易扩散等特征。解决了这些矛盾纠纷，也就抚平了特大城市治理的“面子”。要革除政府一统独大的治理格局，合理设置政府与社会组织的活动边界和权责关系，充分发挥社区社会组织在基层矛盾纠纷调解中的灵活性、专业性优势，破解政府无限责任与有限能力之间的矛盾。构建社会矛盾缓冲机制，推动南京早已实行多年的“大调解”机制实体化运作，有效发挥信访、仲裁、法律服务等“大调解”机制的积极作用，降低政府主导的维稳成本。规范报、刊、台、网等新闻媒体针砭时弊的方式方法，引导新闻舆论弘扬主旋律、传递正能量，消解不断增长和扩散的社会戾气。做实社区协商，凡是与居民生产生活密切相关的社区事务，都要引导居民展开充分对话，形成共识，从源头上减少矛盾纠纷。坚持法治维稳，探索涉诉信访化解新机制，推行诉访分离，革除基层领导干部“乱表态、乱许诺、乱指示”“花钱买平安”等严重阻碍依法处理信访问题的行为。